නිෂ්පාදන

මිනිස් බඩවැලේ සහජීවනයක ඇල්ෆා-මැන්නොසිඩේස් වල Ca2+ මත යැපෙන පවුලක් පිළිබඳ යාන්ත්‍රික අවබෝධය.

Bacteroides thetaiotaomicron මගින් නිදර්ශනය කරන ලද Colonic බැක්ටීරියාව, ආහාරමය පොලිසැකරයිඩ සහ ග්ලයිකාන ධාරක පෝෂ්‍ය පදාර්ථ ලෙස ප්‍රයෝජනයට ගැනීම සඳහා glycoside hydrolases (GHs) විශාල පවුල් භාවිතා කිරීමෙන් මිනිස් සෞඛ්‍යය පවත්වා ගැනීමේ ප්‍රධාන කාර්යභාරයක් ඉටු කරයි.එවැනි GH පවුලේ ව්‍යාප්තිය B. thetaiotaomicron ජෙනෝමය මගින් කේතනය කරන ලද පවුල් 23 GH92 glycosidases මගින් නිදසුන් වේ.මෙන්න අපි මේවා ධාරක N-glycans භාවිතා කිරීම සඳහා තනි විස්ථාපන යාන්ත්‍රණයක් හරහා ක්‍රියා කරන ඇල්ෆා-මැන්නොසිඩේස් බව පෙන්වමු.GH92 mannosidases දෙකක ත්‍රිමාන ව්‍යුහය Ca(2+) හි ජල විච්ඡේදනය සඳහා අම්ලය (ග්ලූටමේට්) සහ පාදක (aspartate) සහාය ලබා දෙමින් වසම් අතුරුමුහුණතෙහි උත්ප්‍රේරක මධ්‍යස්ථානය පිහිටා ඇති වසම් දෙකක ප්‍රෝටීන වල පවුලක් නිර්වචනය කරයි. රඳා පවතින ආකාරය.නිෂේධක සමඟ සංකීර්ණ GH92s හි ත්‍රිමාන ව්‍යුහයන් උත්ප්‍රේරණයේ විශේෂත්වය, යාන්ත්‍රණය සහ අනුරූප ගමන් මාර්ගය පිළිබඳ අවබෝධයක් ලබා දේ.Ca(2+) ප්‍රධාන උත්ප්‍රේරක භූමිකාවක් ඉටු කරයි මැනොසයිඩ් එහි භූගත (4)C(1) පුටු අනුකූලතාවයෙන් සංක්‍රාන්ති තත්ත්වය දෙසට විකෘති කිරීමට උදවු කරයි. (ග්‍රන්ථ නාමාවලිය: Nat.කෙම්Biol.6, 125-32, (2010)

concanavalin A-sepharose තීරුවක් මත ovalbumin glycoasparagines හි ඉදිරිපස සම්බන්ධතා වර්ණදේහය.ලෙක්ටින් වල බන්ධන විශේෂත්වය පිළිබඳ ප්‍රමාණාත්මක අධ්‍යයනයක්.

ovalbumin වලින් ලබාගත් glycoasparagines 10ක් සමඟ Sepharose 4B-immobilized concanavalin A (ConA) හි අන්තර්ක්‍රියා ප්‍රමාණාත්මකව පෙරටුගාමී වර්ණදේහ මගින් විමර්ශනය කරන ලදී.මෙම ක්‍රමයේදී, ConA-Sepharose තීරුවකට කාබෝහයිඩ්‍රේට් ද්‍රාවණයක් අඛණ්ඩව යොදනු ලබන අතර අන්තර්ක්‍රියාවේ ප්‍රබලතාවයේ පරාමිතියක් ලෙස elution front හි ප්‍රමාදය මනිනු ලැබේ.ConA සමඟ එක් එක් සැකරයිඩ සඳහා විඝටන නියතය (Kd) තීරණය කළ හැකිය.p-nitrophenyl-alpha,D-mannoside බන්ධනය පිළිබඳ විශ්ලේෂණයකින් පෙන්නුම් කර ඇත්තේ, Sepharose 4B මත නිශ්චල වීමෙන් පසුව ConA හි බන්ධන ගුණාංග වෙනස් නොවන බවයි.ovalbumin glycoasparagines සෑම එකක්ම විශ්ලේෂණය සඳහා අඩු කරන මෙතිලේෂන් ක්‍රමය මගින් ට්‍රිටියම් සමඟ ලේබල් කර ඇත.ලබාගත් Kd අගයන් සංසන්දනය කිරීමෙන් පෙන්නුම් කළේ ග්ලයිකෝසයිල් දාමයේ ඉතා සුළු ව්‍යුහාත්මක වෙනස්කම් සමඟ ConA බන්ධනය සැලකිය යුතු ලෙස වෙනස් වන බවයි.C-6-සම්බන්ධිත mannose හි C-3 ස්ථානයේ අවම වශයෙන් එක් හයිඩ්‍රොක්සයිල් කාණ්ඩයක් නිදහස් විය යුතු Man alpha 1-6(Man alpha 1-3)Man, නිශ්චිත glycosyl දාම ව්‍යුහයක් ConA විසින් හඳුනා ගන්නා බව ප්‍රතිඵල යෝජනා කරයි.